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虾青素法夫酵母β-胡萝卜素转化酶的生物信息学分析

作者:张爽 许勇 童琳 张忠东 叶红

关键词: 虾青素; 法夫酵母; β-胡萝卜素转化酶; 生物信息学;

摘要:以虾青素中法夫酵母酶氨基酸序列为体育对象,利用ProtParam、SignalP、PSORT、ProtScale、SOMPA、PredictProtein、PROSITE、COILS和SWISS-MODEL等在线预测工具,对其理化性质、亚细胞定位、亲疏水性、二级结构、三级结构等进行分析。结果表明,该转化酶由557个氨基酸残基构成,是一种无信号肽,具有跨膜结构,定位于细胞色素氧化酶中的可溶性亲水蛋白。α螺旋和无规卷曲为主要的二级结构元件。三级结构以PDB ID 5vcc.1的B链为模板,功能预测为细胞色素P450。生物信息学手段分析预测结果可靠性较高,为进一步体育虾青素的生物合成调控机制提供了理论依据。 


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